Toen Groningen in 1594 ‘weer’ bij de Republiek der Zeven Verenigde Nederlanden werd gevoegd, was de gereformeerde godsdienst de enige toegestane godsdienst in het land. Al vanaf 1581 had de Republiek de katholieke godsdienst verboden, al was er wel gewetensvrijheid. De katholieken waren toen genoodzaakt om hun geloof achter gesloten deuren te belijden. Rond 1600 werd het klimaat weer toleranter en konden er weer rooms-katholieke staties (kerken)  worden gesticht. In Uithuizen gebeurde dat in 1606. Na enkele andere gebouwen te hebben gebruikt, bouwde de kerk rond 1860 de H. Jacobus de Meerderekerk aan de Hoofdstraat.

Onlangs zijn de prachtige glas-in-lood-vensters gerestaureerd en zijn de betonnen kozijnen hersteld, nadat de gietijzeren wapening was gaan roesten. Het orgel in de kerk is gebouwd door Maarschalkerweerd in 1908.