De Kerk van de Protestantse Gemeente Bunnik is een witgepleisterde zaalkerk met een oorspronkelijke vierkante gemetselde toren die teruggaat tot ongeveer 1200. Deze kerk, gelegen in het dorpscentrum op de voormalige St. Antonisbrink, heeft een oude Romaanse toren gebouwd met ‘Kloostermoppen’. In de 14e eeuw verving men het oorspronkelijke houten schip door een stenen schip met rondboogvensters en een houten dak.

De kerk heeft in de loop der eeuwen meerdere grote verbouwingen ondergaan, waaronder reparaties na een storm in 1674 en herstelwerkzaamheden na de inkwartiering van Franse troepen in 1787. In 1839 werd een speciale orgeltribune gebouwd, en in 1840 volgde een grote restauratie, inclusief de bouw van een consistoriekamer en opknappen van de pastorie. De hele kerk kreeg toen een houten Mansardekap met leien.

In 1938 werd de toren voorzien van een nieuwe spits en leien dakbedekking, zoals vóór 1674. Delen van de toren werden opnieuw opgemetseld. Dit is nog steeds te zien in de gevel. In 1954, tijdens een grote restauratie en verbouwing, werd de mansardekap vervangen door een zadeldak met pannen. De consistoriekamer bij de toren werd afgebroken en verplaatst naar de achterzijde van het koor. Tevens werden de grafkelders in de kerk verwijderd en gevuld met zand. Sindsdien heeft de kerk weinig structurele wijzigingen ondergaan, behalve een restauratie in 2013/2014 als gevolg van de samenvoeging van de hervormde en gereformeerde gemeenten.